Масса БПЛА-истребителя должна быть небольшой, чем меньше, тем лучше. Предлагаю постараться уложиться в 20 кг. Идеологически это - дальнобойная поршневая многоразовая зенитная ракета.
Вооружение - я предлагаю посмотреть на гранатомет муха, и сделать что-то похожее, но не противотанковое, а противоавиационное. Нечто среднее между мухой и дробовиком. Внутри ствола находится ракета. При выстреле она разгоняется, сжигая большую часть топлива до вылета из ствола. Когда топливо заканчивается, из ракеты силами инерции выбрасывается пучек картечи, который поражает БПЛА противника. Дальность стрельбы - 50-100 м. На такое расстояние истребитель должен подлететь к цели.
Система наведения: предлагаю для начала рассмотреть активную лазерную. Лазеры довольно компактны, и лазер вполне влезает в любой беспилотник. При этом дальность работы лазера такая же, как дальность работы оптической системы БПЛА противника, ограничена прозрачностью атмосферы. Минус лазера - он непригоден для самостоятельного поиска цели. То есть наземная станция должна сначала навести истребитель на цель, а уже потом его запускать.
Плюс такой системы - реализация принципа выстрелил и забыл. Можно запустить сразу несколько истребителей для увеличения вероятности поражения.
Главный плюс перед зенитными ракетами у такой системы: большая дальность при небольшом размере и стоимости истребителя по сравнению с ракетой.
Минус - не все цели может догнать.